Ασφαλώς το όνομά του θα το οφείλει στο ομώνυμο φυτό. Ως Dafni αναφέρεται στην απογραφή των Ενετών του 1583 με 187 κατοίκους. Οι Τούρκοι της Δάφνης, που έφθαναν τις 60 οικογένειες, ανήκαν στους φανατικότερους της επαρχίας και οι Χριστιανοί του χωριού, αλλά και οι διερχόμενοι Έλληνες, υφίσταντο τα πάνδεινα. Οι Δαφνιώτες Τούρκοι ανήκαν στο δόγμα του Αλή, θετού γιού και γαμπρού του Μωάμεθ και η σκληρότητά τους εμισείτο και από αυτούς τους ίδιους τους «ορθόδοξους» ομοθρήσκους τους. Έτσι το 1897 όταν οι Χριστιανοί πολιόρκησαν τους Τούρκους στο Τζαμί του χωριού ουδεμία επιείκεια απέδειξαν και αφού εφόνευσαν 150 Τούρκους συνέλαβαν αργότερα και 30 διαφυγόντες που κρύφθηκαν στο σπήλαιο στο όρος Κοπροκεφάλα στην περιοχή των Κρυών. 

Η Δάφνη Λασιθίου βρίσκεται στην περιφέρεια Κρήτης και πιο συγκεκριμένα στην περιφερειακή ενότητα ΛΑΣΙΘΙΟΥ. Ανήκει στον δήμο ΣΗΤΕΙΑΣ (Τοπική Κοινότητα Κρυών, δημοτική κοινότητα ΣΗΤΕΙΑΣ). Η επίσημη ονομασία είναι η Δάφνη και έδρα του δήμου Σητείας. Παλαιότερα με το σχέδιο Καποδίστριας ανήκε στο δήμο ΣΗΤΕΙΑΣ. Έως και το 2010, χρονιά κατά την οποία η διοικητική διαίρεση της Ελλάδας διαμορφώθηκε σύμφωνα με το σχέδιο Καλλικράτης ανήκε στο Δήμο ΣΗΤΕΙΑΣ του νομού ΛΑΣΙΘΙΟΥ. Γεωγραφικά ανήκει στο γεωγραφικό διαμέρισμα Κρήτη, έχει υψόμετρο 581 μέτρα, γεωγραφικό μήκος 25.9919920319 και γεωγραφικό πλάτος 35.1089329799. 

Τέλος, το πιο σημαντικό και αξιοθαύμαστο πλεονέκτημα του χωριού της Δάφνης είναι η ιδιαίτερη ομορφιά που αποκτά μετά από τις συχνές χιονοπτώσεις, που πραγματοποιούνται την περίοδο του χειμώνα.